W Wielkiej Brytanii pojawił się nowy wariant SARS-CoV-2, co na razie o nim wiemy? Od kilku tygodni obserwuje się gwałtowny wzrost liczby przypadków COVID-19 w południowo-wschodniej Anglii, co skłoniło władze brytyjskie do zaostrzenia środków ograniczających. Analiza danych dotyczących sekwencji genomu wirusa zidentyfikowała duży odsetek przypadków należących do nowego wariantu SARS-CoV-2.
- Google poinformuje Cię, kiedy szczepionki COVID-19 będą dostępne w Twojej okolicy
- Moderna rozpoczyna testowanie swojej szczepionki COVID-19 wśród nastolatków
- Pfizer obniża dawki szczepionki COVID-19, które ma wyprodukować do 2020 roku
Co wiemy o nowym wariancie SARS-CoV-2?
Nowy szczep ma kilka mutacji w spicule, czyli białku używanym przez wirus do przedostania się do komórek ludzkich i według Europejskiego Centrum ds. Zapobiegania i Kontroli Chorób (ECDC) może mieć nawet siedemdziesięciokrotnie wyższą zdolność przenoszenia. Chociaż w tej chwili nie wydaje się, aby ten nowy wariant, zwany tymczasowo VUI-202012/01, był bardziej śmiercionośny lub wywoływał poważniejsze infekcje, wciąż jest za wcześnie, aby poznać szczegóły.
W każdym razie wirusy mutują bardzo często i nie jest to pierwszy znaleziony wariant, który niepokoi służby zdrowia. Na przykład zeszłego lata w Danii miliony norek zakażonych innym wariantem SARS-CoV-2, który stanowił poważne zagrożenie dla ludzi. Nieuniknione pytanie, które wszyscy sobie zadajemy, brzmi: czy szczepionki będą skuteczne również w przypadku tych nowych wariantów wirusa, które się pojawiają?
„Jak dotąd nie obserwujemy zwiększonej zjadliwości (nasilenia klinicznego) ani większych zmian w S (szczyt białka), które zmniejszyłyby skuteczność szczepionki” – stwierdza Julian Tang, honorowy profesor wirusologii klinicznej na Uniwersytecie w Leicester, że: „Nowe wirusy z czasem dostosują się do nowego gospodarza – wraz ze spadkiem śmiertelności i prawdopodobnie zwiększeniem zdolności przenoszenia. Nie ma sensu, aby wirus zabijał swojego gospodarza – raczej lepiej, aby replikował się na wysokim poziomie w gospodarzu, powodując kilka objawów – aby gospodarz mógł pozostać mobilny i wyglądać dobrze (bezobjawowo) – aby umożliwić mu dalsze mieszanie się z tych, którzy nadal są podatni – i dalej rozprzestrzeniają jego geny. Prawdopodobnie widzimy teraz część tego nowego procesu adaptacji gospodarza w SARS-COV-2, ale okaże się, czy śmiertelność będzie inna w tym wariancie niż w poprzednim. ”
Czy PCR jest w stanie wykryć nowy wariant?
Kolejne pytanie, które się pojawia, dotyczy tego, czy testy, które są zwykle używane, są w stanie wykryć nowe szczepy. Dyrektor SARS-CoV-2 Genomics Initiative w Wellcome Sanger Institute wyjaśnia, że: „Jedna z mutacji w nowym wariancie usuwa sześć zasad w genomie wirusa, które kodują aminokwasy 69 i 70 białka kolca. Przez przypadek region ten jest jednym z trzech celów genomowych wykorzystywanych w niektórych testach PCR, więc w tych testach „kanał” daje negatywny wynik w nowym wariancie. Jednak pozostałe dwa kanały, na które nowy wariant nie ma wpływu, zapewniają redundancję i oznaczają, że wirus jest nadal wykrywany przez połączony test. Nie znam żadnych komercyjnych testów, które wykorzystują tylko jeden cel w tej części genomu wirusa, ale jeśli istnieją, należy je dokładnie zbadać ”.
Co wiemy o nowym wariancie SARS-CoV-2?
ECDC zaleca również przegląd wyników testów PCR i monitorowanie podejrzewanych przypadków ponownego zakażenia COVID-19 poprzez sekwencjonowanie wirusów wyizolowanych z tych przypadków w celu zidentyfikowania nowych wariantów. „Wdrażając szczepienia, należy zapewnić ścisłe monitorowanie osób zaszczepionych COVID-19, aby zidentyfikować możliwe niepowodzenia szczepień i przełomowe infekcje. Wirusy wyizolowane z tych przypadków należy zsekwencjonować i scharakteryzować genetycznie i antygenowo ”- podała agencja w swoim raporcie na temat nowego wariantu SARS-CoV-2.